Статьи
Сборник статей по проекту
Modeling social, environmental and biological determinants of tuberculosis
M. Murray, O. Oxlade, H-H. Lin
Mathematical models have facilitated our understanding of infectious diseases dynamics and proved useful tools to compare control scenarios when interventional studies are not feasible or ethical. Here, we summarize evidence linking social, economic and biologic determinants to tuberculosis (TB) and review modeling approaches that have been used to understand their contribution to the epidemic dynamics of TB. Specifi cally, we
fi nd evidence for associations between smoking, indoor air pollution, diabetes mellitus, alcohol, nutritional status, crowding, migration, aging and economic trends, and the occurrence of TB infection and/or disease.
ОБРАЗЦОВАЯ ПРАКТИКА УХОДА ЗА БОЛЬНЫМИ ТУБЕРКУЛЕЗОМ
Руководство для стран с низким уровнем дохода
Джини Уильямс (Gini Williams), Эдит Аларсон (Edith Alarcon), Сиринафа Джиттимани (Sirinapha Jittimanee)…
Данное руководство разработано для всех, кто занимается выявлением и уходом за больными ТБ в учреждениях первичного звена здравоохранения, неотложной (стационарной) врачебной помощи и по местам проживания больных в странах с низким уровнем дохода. Его задача – улучшить качество оказания помощи больным и таким образом улучшить результаты работы программ ТБ контроля. В руководстве подробно рассказывается о том, как наилучшим образом организовать помощь для пациентов, обратившихся в учреждения здравоохранения при наличии подозрительных на ТБ симптомов, и как организовать уход за больными активной формой заболевания.
Опыт применения MTBDR plus в экспресс диагностике мультирезистентного туберкулеза
Т.Ш. Абилдаев , А.Х.Аленова, М.М Аденов, В.Л.Бисмилда, Ш.К.Игликова, Л.Т.Чингисова
Национальный центр проблем туберкулеза МЗ РК, г.Алматы, Казахстан
Туберкулез по-прежнему остается одной из актуальных проблем здравоохранения во всем мире. По данным ВОЗ, глобальная среднегодовая смертность, обусловленная туберкулезом, составляет около 2 млн. случаев.
В Республике Казахстан уровень заболеваемости по туберкулезу в 2010 г составил 95,3 на 100 тысяч населения и смертности 10,6 на 100 тысяч населения. Сложные социально-экономические условия жизни населения, миграция, увеличение числа штаммов, устойчивых к противотуберкулезным препаратам, являются одними из основных причин напряженной эпидемической ситуации в нашей стране. Следует отметить, что в последние годы темпы роста основных эпидемиологических показателей снизились. Однако тенденция к продолжению накопления резервуара инфекции остается и по настоящее время. Особо настораживает увеличение распространенности случаев заболевания с первичной лекарственной устойчивостью [1].
А.Х Аленова1, В.Л Бисмилда1, А.Р. Ибраева2, А.Ж.Ахметова3, У.А.Кожамкулов3, Т.Ш.Абилдаев1, Ш.К.Игликова1, Л.Т. Чингисова1, Е.М. Раманкулов3
1Национальный центр проблем туберкулеза МЗ РК , 2Евразийский Национальный университет им. Л.Н.Гумилева, 3Национальный центр биотехнологии КН МОН РК.
В Республике Казахстан внедряется экспресс-метод диагностики мультирезистетного туберкулеза (МЛУТБ) MTBDR Plus (Hain LifeScience, Gmbh) позволяющий выявить мутации, ответственные за резистентность к изониазиду (Н) и рифампицину (R) в течение 2 дней и установить быстро и точно ряд генов (rpoВ, katG, inhA), детерминирующих МЛУ ТБ. Однако, установить детально нуклеотидные последовательности локусов генома, принимающих участие в формировании устойчивости к Н и R, можно только с помощью более сложных молекулярно-генетических методов, что важно для выяснения особенностей генотипа M. Tuberculosis (МБТ), циркулирующих в стране.
Ulan Kozhamkulov*, Ainur Akhmetova, Saule Rakhimova, Elena Belova1,Arike Alenova1, Venera Bismilda1, Lyailya Chingissova1, Shahimurat Ismailov1, Erlan Ramanculov, and Kuvat Momynaliev, National Center for Biotechnology, Astana; and National Center for Tuberculosis Problems, Almaty, Republic of Kazakhstan (Received December 17, 2010. Accepted March 23, 2011)
SUMMARY:
Kazakhstan is one of the 14 countries with a high rate of morbidity due to multidrugresistant tuberculosis (MDR TB) in WHO European region. The aim of our study was to characterize mutations associated with drug resistance to rifampicin and isoniazid in Mycobacterium tuberculosis isolates from Kazakhstan. M. tuberculosis strains were isolated from TB patients in different regions of Kazakhstan. A drug susceptibility test was performed on Lowenstein-Jensen medium using the absolute concentration method. Sequencing analysis was performed of the rpoB rifampicin resistance-determining region and the katG gene, the oxyR-ahpC intergenic region, and the inhA promoter region in MDR M. tuberculosis isolates, in 51 isoniazid-resistant isolates, and in 13 rifampicin-resistant isolates.
The mutational analysis revealed that the most frequent mutations associated with rifampicin and isoniazid resistance in M. tuberculosis are the substitutions at codons 531 (82.7z) and 315 (98.4z) in rpoB and katG genes, respectively. In addition, we have found mutations with lower frequency at codons 526 (8.4z), 533 (1.5z), and 516 (1.1z) in the rpoB gene. In 6.2z of the isolates, no mutations
found in the rpoB gene. The findings of this study provide useful data for a better understanding the mutation spectrum of isoniazid and rifampicin resistance among strains isolated from patients in Kazakhstan. Our results are also useful for the development of diagnostic tests of MDR M. tuberculosis.
В данной работе представлены данные по определению нуклеотидных последовательностей генов, обуславливающих лекарственную устойчивость к основным противотуберкулезным препаратам — изониазиду и рифампицину 151 клинических изолятов M.tuberculosis, циркулирующих на территории четырех областей Казахстана (Алматинская, Актюбинская, Северо–Казахстанская, Карагандинская области). В работе использовались современные молекулярно-генетические методы ДНК-секвенирование.
Туберкулез относится к группе социально значимых заболеваний и является важной медико-социальной проблемой, наносящий значительный материальный урон из-за потери трудоспособности и преждевременной смерти наиболее продуктивного населения [1].
V. V. Demkina, I. N. Kornevaa, Yu. A. Ryazanovaa, T. A. Muminovb, Sh. A. Beisembayevab, B. T. Zhakipbayevab, G. A. Shopayevab, and A. M. Dauletbakovab
Institute of Molecular Genetics, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia, S. D. Asfendiarov Kazakh National Medical University, Almaty, Kazakhstan, Received October 1, 2007
Abstract—A three-primer PCR assay has been designed for detecting possible deletions in the RD7 chromo¬somal region of the Mycobacterium tuberculosis complex. The assay gives rise to amplicons of different sizes depending on the presence or absence of deletions. The PCR assay was applied to 176 isolates from lung tuber¬culosis cases collected in various areas of Kazakhstan in the summer of 2004. Prior to assay, the isolates were characterized by culture and biochemical tests. The RD7 genotyping showed neither polymorphism nor dele¬tions in the RD7 genome region. Some strains were additionally characterized by a PCR-RFLP analysis of the gyrB and hsp64 genes. The RFLP patterns corresponded to M. tuberculosis. The results of the study were con¬sistent with certain previous studies, which indicates the population stability of RD7 in M. tuberculosis strains. Species identification of the isolates showed that M. tuberculosis sensu stricto was the principal causative agent of human lung tuberculosis in Kazakhstan.
Tuberculosis in Kazakhstan: analysis of risk determinants in national surveillance data
Assel Terlikbayeva*, Sabrina Hermosilla, Sandro Galea, Neil Schluger, Saltanat Yegeubayeva, Tleukhan Abildayev, Talgat Muminov, Farida Akiyanova, Laura Bartkowiak, Zhaksybay Zhumadilov, Almaz Sharman and Nabila El-Bassel
Development of tuberculosis (TB) is determined by various risk factors and the interactions of temporal and spatial distributions. The aim of this study was to identify the most salient risk factors for TB disease as well as multidrug resistant TB (MDR-TB) at the oblast (provincial) level in Kazakhstan.
Correlational and descriptive analyses were conducted at the oblast and national level using data provided by the country’s National Institute of Geography (NIG) and the National Tuberculosis Program (NTP). Reported incident case notification rates (CNRs) and prevalence vary by oblast, thus the study investigated which determinants contributed to this regional variation and compared burdens among oblasts.
Results: The results showed that while tuberculosis CNRs decreased over the study period, MDR-TB conversely increased. Two oblasts -Atyrauskaya and Mangystauskaya — presented especially significant anomalies with large decreases in TB incident CNRs coupled with comparatively large increases in MDR-TB incident CNRs.
Conclusion: Understanding the distribution of TB and MDR-TB cases and associated risk factors, especially the “unknown risk factor” categorization points to the need for future research.
Pulmonary tuberculosis risk factors in Almaty, Kazakhstan
Baurzhan Zhussupov, MS, Sabrina Hermosilla, Assel Terlikbayeva, Angela Aifah, Xin Ma, Zhaxybay Zhumadilov
This study examines the association between social and behavioral drivers of tuberculosis (TB) incidence in Almaty Oblast, Kazakhstan.
Methods: We used a matched case-control design to estimate the role of factors for acquiring TB among 324 individuals. Participants included 110 TB index cases with newly detected pulmonary TB, 107 household contacts of index cases and 107 community controls.
Results TB cases were more likely to be younger, recent smokers and have diabetes, when compared to household controls. Between TB cases and community controls, TB is significantly associated with age, non-married family status, living in rented home, recent smoker, and having diabetes. Comparing TB cases and with both control groups, we found that foreign birth was also associated with incident TB case status.
Conclusions: Our findings confirm the role of modifiable risk factors for TB in Kazakhstan;highlighting the importance of developing interventions addressing social determinants and proximate risk factors for high TB burden regions.
Tuberculosis, drug use and HIV infection in Central Asia: An urgent need for attention
Neil W. Schluger,∗, Nabila El-Bassel, Sabrina Hermosilla, Assel Terlikbayeva,
Meruyert Darisheva, Angela Aifah, Sandro Galea
Introduction: Rates of tuberculosis in Central Asia are extremely high, and even more alarming are the very high rates of multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) in Kazakhstan, Uzbekistan, Tajikistan and Kyrgyzstan. In addition, rates of HIV infection related to injection drug use seems to be rising as well, thus creating conditions for a potentially devastating co-epidemic of TB/HIV and MDR-TB/HIV which would have terrible consequences for public health in these countries.
Current status: In many countries of Central Asia, diagnosis of tuberculosis still rests on clinical grounds or simple technologies such as chest radiograph and sputum smear examination. Modern molecular techniques such as GenExpert are being introduced in Kazakhstan and Uzbekistan, and perhaps soon in Kyrgyzstan. Treatment of TB is still often centered around prolonged inpatient stay at TB hospitals. Only a minority of patients with HIV infection are receiving ART, and TB and HIV services are not well integrated. Needle exchange programs are becoming increasingly available, but opioid substitution therapy is rarely used in Central Asia. TB, drug treatment and HIV services are generally not well-integrated.
Conclusions: To combat this developing storm, integration of TB services, HIV care, and substance abuse treatment programs is needed urgently to allow efficient and effective diagnosis and treatment of these conditions in a coordinated manner.
Даришева М.А., Жусупов Б, Терликбаваева А, Берикова Э., Бесстрашнова Я., Исаева Р., Акильжанова А.
ВЛИЯНИЕ ВИЧ-ИНФЕКЦИИ НА ИСХОДЫ ЛЕЧЕНИЯ ТУБЕРКУЛЕЗА И РАЗВИТИЕ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ
М.А. ДАРИШЕВА, Б.С. ЖУСУПОВ , А.М. ТЕРЛИКБАЕВА, Э.А. БЕРИКОВА, А.Х.
Изучено влияние ВИЧ-инфекции на исходы лечения и развитие множественной лекарственной устойчивости среди новых случаев больных туберкулезом. В работе использованы данные Национального регистра больных ТБ.Выявлено, что наличие ВИЧ-инфекции ухудшает исходы лечения ТБ, повышает риск смертности и ассоциируется с повышенной вероятностью развития лекарственной устойчивости к противотуберкулезным препаратам
Исследование генов-кандидатов предрасположенности к туберкулезу
Т.А. МУМИНОВ, Г.А. ШОПАЕВА, Б.Т. ЖАКИПБАЕВА, Ш.А. БЕЙСЕМБАЕВА, СЕ. РАХИМОВА, A.M. ТЕРЛИКБАЕВА
Генетические факторы в значительной мере определяют восприимчивость к различным заболеваниям. Наиболее распространенным методом изучения генетических механизмов течения туберкулеза является поиск ассоциаций заболевания с полиморфизмом кандидатных генов. Микобактерии туберкулеза являются универсальными активаторами рецепторов макрофагов и соответственно регуляторами иммунного ответа. Кроме того, липопротеины микобактерии напрямую регулируют активацию Т-лимфоцитов через Toll-like рецепторы 1 и 2, поэтому изучение полиморфизма Toll-like рецепторов представляет значительный интерес в выяснении чувствительности макроорганизма к туберкулезу. Выяснено, например, что полиморфизм Toll-like рецепторов играет важную роль в предрасположенности к внелегочному туберкулезу, определяет количество натуральных киллеров в организме больного туберкулезом. Выясняется также ассоциативная роль полиморфизма хемоатрактантного протеина-1 с повышенной чувствительностью к легочному туберкулезу. Полиморфизм генов цитокинов, в частности в промоторном регионе, может быть одним из механизмов, участвующих в формировании индивидуальной вариабельности уровня продукции белка. При патологии этот феномен имеет важное значение, так как цитокины являются ключевым фактором формирования эффективного иммунного ответа.
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ ПОПУЛЯЦИОННОЙ ВАРИАБЕЛЬНОСТИ ШТАММОВ МВТ
ТА. МУМИНОВ, Б.Т. ЖАКИПБАЕВА, Ш.А. БЕЙСЕМБАЕВА, К.Е. БЕРИКХАНОВА, АР. АКИЛЬЖАНОВА, AM. ТЕРЛИКБАЕВА, М.А. ДАРИШЕВА
В статье представлены современные методы, используемые для изучения молекулярной эпидемиологии туберкулеза и критерии их выбора. Проведение исследований с применением методов молекулярного типирования может способствовать лучшему пониманию закономерностей распространения возбудителей разных субтипов из одного региона или страны в другой, изучить зависимость гетерогенности субтипов от географического расположения региона, установить возможную связь субтипов с вирулентностью, определить особенности передачи инфекции. Применение данных методов является надежным способом доказательства идентичности штаммов и представляется особенно актуальным в регионах с высокой эндемичностью заболевания, таких как Казахстан.
Современные методы молекулярной биологии и генетическое разнообразие микобактерий туберкулеза
Аленова А.Х., Абилдаев Т.Ш., Рахимова С.Б.